Amasya, Osmanlı Dönemi yapıları yönünden zengin bir şehirdir. Yine bu eser de Paşa Camii gibi Osmanlı döneminden günümüze kadar gelmeyi başarmıştır. Bu eserlerin başında yer alan II. Beyazıt Camii ve Külliyesi, Amasya Valiliği ve Amasya Valisi Şehzade Ahmet tarafından 1481 – 1486 yılları arasında babası adına yaptırılmıştır.
forumadasi.com
Cami, medrese, imaret ve şadırvandan oluşan külliyenin mimarı ise Şemseddin Ahmet Bey’dir. Caminin batı yönünde bulunan U şekilli medrese, 1922 yılından bu yana kütüphane olarak hizmet vermektedir. Caminin doğusunda bulunan ve imaret olarak inşa edilmiş L şeklindeki büyük yapı ise günümüzde Maket Amasya Müzesi olarak ziyarete açılmıştır. Yapı aynı zamanda ii Bayezid olarak da ifade edilmektedir.

Külliyenin yapım yılı sırasında bahçeye dikilen çınar ağaçları 500 yaşındadır.